精準醫(yī)療將腫瘤基因分型與靶向治療相結(jié)合用于肺癌的治療，改變了肺癌臨床治療的格局。EGFR、ALK、ROS1（EAR）是肺癌靶向治療的重要靶點，EAR基因同步檢測已被歐洲ESMO、中國肺癌診療專家共識等推薦，是讓患者從肺癌精準醫(yī)療中獲益的有效策略（EAR同步檢測的臨床意義詳見http://news.bioon.com/article/6679926.html）。目前應用于腫瘤基因分型檢測的技術眾多，包括實時熒光定量PCR（qPCR）、測序、數(shù)字PCR（ddPCR）、基因芯片、熒光原位雜交（FISH）等。而可用于EAR基因同步檢測的高通量檢測技術主要有測序、基因芯片、qPCR等。
Sanger測序作為早期的測序技術，依然是基因檢測的金標準，但是由于其檢測靈敏度低，操作復雜，成本高等問題，限制了其臨床應用。NGS技術的出現(xiàn)使測序成本大大降低，檢測靈敏度和通量有所提高，且“精準醫(yī)療”計劃的提出也使得NGS技術受到行業(yè)各界的追捧，已成為目前醫(yī)學領域中較為火熱的研究技術。在高通量測序方面，CFDA先后批準了幾款應用于NIPT的測序儀和檢測試劑，但是在腫瘤檢測方面，由于NGS應用于腫瘤細胞突變檢測的標準化和質(zhì)量控制尚未形成共識，目前還沒有高通量測序儀和高通量檢測試劑盒獲批，僅允許臨床試點單位以自制試劑（LDTs）的形式開展檢測服務，可見，國家對于其臨床的廣泛應用仍持保留態(tài)度。此外，高通量測序在成本效益上適合于開發(fā)同時檢測多目標基因panel（幾十上百個基因或靶點）產(chǎn)品，但因為有些位點突變率很低，很難找到足夠的病人開展臨床試驗，并且檢測結(jié)果也無法去驗證，從長遠來看，此類產(chǎn)品很難以獲批，只能以自制試劑（LDTs）的形式在臨檢實驗室使用，短期內(nèi)還難以實現(xiàn)臨床的廣泛應用。
基因芯片技術是在高通量測序技術出現(xiàn)之前被廣泛用于多基因檢測的技術。在腫瘤診斷領域，基因芯片技術通過對腫瘤基因表達譜分析，組成腫瘤基因診斷芯片，研究腫瘤基因的功能，既可用于腫瘤普查又能達到早期診斷和早期治療的目的。但其要成為臨床診斷和治療腫瘤普遍采用的技術仍有一些關鍵問題需要解決，如操作繁瑣、成本高和檢測時間長、易出現(xiàn)假陽性，且檢測結(jié)果往往還需要測序或定量PCR進行驗證等等。
相比之下，經(jīng)典的qPCR技術具備操作簡便、靈敏度高、特異性好、結(jié)果判讀簡單等優(yōu)勢，已成為臨床廣泛應用的檢測方法。在檢測通量上，一般認為qPCR技術受熒光染料種類限制，不適合多基因檢測。然而隨著多重熒光PCR技術的發(fā)展、一些創(chuàng)新性的探針和引物設計技術的出現(xiàn)，qPCR平臺已經(jīng)克服了通量瓶頸。在腫瘤靶向用藥檢測領域，已有創(chuàng)新性的多種基因聯(lián)合檢測的產(chǎn)品上市，代表性產(chǎn)品有：人類KRAS/NRAS/PIK3CA/BRAF基因突變聯(lián)合檢測試劑盒、人類ALK基因融合和ROS1基因融合聯(lián)合檢測試劑盒等。因此qPCR法是目前較易于臨床推廣的可用于EAR同步檢測的檢驗方法。
目前，qPCR平臺技術又包括ARMS（艾德、凱杰）、HRM（為真）、Taqman（羅氏）等技術，主要差別為特異性、靈敏度，其中臨床廣泛應用的依然是ARMS技術。根據(jù)2015年EMQN室間質(zhì)評調(diào)查數(shù)據(jù)（表1）可知，以ARMS技術開發(fā)的AmoyDx和Qiagen的商業(yè)化試劑盒產(chǎn)品在臨床上的使用率很高，占比高達43.81%。
表1 2015 EMQN室間質(zhì)評活動中使用方法比率
在肺癌精準醫(yī)療的用藥檢測上，CFDA批準的肺癌臨床用藥檢驗產(chǎn)品有數(shù)十個（表2）。從技術上來看，qPCR技術依然是臨床應用的主流技術，該技術下獲批的肺癌臨床用藥檢測產(chǎn)品很多，覆蓋了肺癌目前已獲批上市的靶向藥物的所有靶點，并且已有基于ARMS技術的EAR三基因聯(lián)合檢測產(chǎn)品上市。
表2 CFDA獲批的的肺癌EGFR、ALK、ROS1基因突變檢測產(chǎn)品
從臨床實際應用角度出發(fā)，目前已發(fā)現(xiàn)的肺癌相關驅(qū)動性基因有十多個，并還不斷的有新的靶點被發(fā)現(xiàn)出來。各大醫(yī)藥企業(yè)紛紛布局臨床研究，針對這些靶點開發(fā)新的靶向藥物。相信隨著肺癌新靶點的發(fā)現(xiàn)和新靶向藥物的研發(fā)，高通量檢測更多靶點的技術將更有利于肺癌精準醫(yī)療決策的制定。我們期待高通量測序技術能解決臨床應用相關問題、監(jiān)管機構能通過政策改革，推動LDTs的臨床應用規(guī)范化和標準化建設。同時，也期待有越來越多機構通過技術創(chuàng)新，在適合于臨床應用的技術平臺上，如qPCR技術平臺，開發(fā)出同時檢測更多靶點的檢測產(chǎn)品，協(xié)助臨床制定優(yōu)異治療方案，為患者節(jié)省寶貴時間。
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